66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0970 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  100 
 
 		 438 aa  892    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  71.46 
 
 		 439 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  99.54 
 
 		 438 aa  888    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  90.83 
 
 		 438 aa  825    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  75.23 
 
 		 439 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  65.37 
 
 		 441 aa  595  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  64.49 
 
 		 443 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  38.43 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  32.56 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  37.21 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  36.59 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  36.43 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  36.03 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.05 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  36.92 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  31.77 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  31.32 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  34.49 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  34.45 
 
 		 455 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  32.96 
 
 		 451 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  34.81 
 
 		 435 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  32.21 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  35.62 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  31.19 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 		 453 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  33.72 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  33.94 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  33.41 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  34.95 
 
 		 441 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  33.57 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  31.88 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  31.85 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  30.68 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  32.87 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  29.98 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  29.84 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.13 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  27.27 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  27.11 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  23.72 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  27.94 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  32.64 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  32.64 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  29.86 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  29.93 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  29.17 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  28.1 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  28.1 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  28.1 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  27.45 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 371 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  27.45 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  27.45 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  25.87 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 459 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  27.7 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>