75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4870 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  904    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  71.59 
 
 		 458 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  79.5 
 
 		 446 aa  733    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  72.3 
 
 		 452 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  70.16 
 
 		 454 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  69.21 
 
 		 445 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  64.92 
 
 		 451 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  61.94 
 
 		 434 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  64.17 
 
 		 455 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  63 
 
 		 435 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  63.62 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  53.98 
 
 		 452 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  56.42 
 
 		 452 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  57.27 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  54.95 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  53.38 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  53.38 
 
 		 446 aa  498  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  34.73 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  31.88 
 
 		 438 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  31.88 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  31.01 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  30.27 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  32.44 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  30.41 
 
 		 441 aa  202  7e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.4 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  32.38 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  32.97 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  33.55 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.47 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  32.17 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  31.92 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.88 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  32.51 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  32.16 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  30.79 
 
 		 437 aa  159  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  32.39 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  32.37 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  28.63 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  32.48 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  27.79 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  27.57 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  30.9 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  26.37 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  30.14 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  30.61 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  30.89 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  29.58 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  32.52 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  29.58 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  30.08 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  30.08 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  31.15 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 379 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  26.53 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  30.89 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  29.29 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  29.29 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  27.73 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  27.48 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  31.58 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 518 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  27.54 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  24.6 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  40.91 
 
 		 368 aa  43.5  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>