48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3777 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  100 
 
 
430 aa  865    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  46.73 
 
 
430 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  41.96 
 
 
443 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  41.07 
 
 
439 aa  322  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  38.43 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  38.43 
 
 
438 aa  312  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  38.52 
 
 
438 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  38.84 
 
 
439 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  37.99 
 
 
441 aa  296  7e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.67 
 
 
437 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  36.38 
 
 
437 aa  255  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  35.25 
 
 
437 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  34.86 
 
 
453 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  34.22 
 
 
434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  34.22 
 
 
445 aa  226  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  35.84 
 
 
429 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
449 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  34 
 
 
435 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  31.71 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  33.64 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  31.49 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  34.24 
 
 
449 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  34.85 
 
 
428 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  33.7 
 
 
446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 
450 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  34.01 
 
 
455 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  33.26 
 
 
452 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  33.26 
 
 
452 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  32.41 
 
 
451 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  32.16 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  30.31 
 
 
452 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  32 
 
 
452 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  32 
 
 
453 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  32 
 
 
454 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  31.11 
 
 
458 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  31.11 
 
 
418 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  33.71 
 
 
424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 
418 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
453 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  32.81 
 
 
441 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  31.43 
 
 
456 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  26.07 
 
 
467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  25.74 
 
 
455 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
396 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  26.06 
 
 
440 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  26.71 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  28.43 
 
 
502 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  28.92 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>