64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2145 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  100 
 
 
453 aa  920    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  65.59 
 
 
437 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  62.73 
 
 
437 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  61.11 
 
 
437 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  62.5 
 
 
428 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  60 
 
 
449 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  58.67 
 
 
449 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  59.68 
 
 
441 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  58.67 
 
 
449 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  54.63 
 
 
429 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  37.44 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  37.12 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  37.35 
 
 
443 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  37.21 
 
 
438 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  36.2 
 
 
439 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  35.65 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 
424 aa  242  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  34.86 
 
 
430 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  33.02 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  34.95 
 
 
418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  35.19 
 
 
418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  28.77 
 
 
430 aa  180  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  32.43 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  33.69 
 
 
454 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  31.05 
 
 
452 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  31.03 
 
 
445 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  31.9 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  33.55 
 
 
452 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 
396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  34.73 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  32.17 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  30.3 
 
 
446 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  31.48 
 
 
377 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  34.16 
 
 
451 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  30.63 
 
 
446 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  30.42 
 
 
446 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  30.22 
 
 
452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
453 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  32.13 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  33.72 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 
450 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  32.01 
 
 
435 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  29.38 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  25.98 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  23.8 
 
 
455 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  35.37 
 
 
452 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  30.07 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  31.94 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  31.94 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  30.56 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0012  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 
472 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.728091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4155  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  28.67 
 
 
448 aa  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  28.67 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  27.87 
 
 
436 aa  46.6  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  29.5 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5333  homoserine dehydrogenase  31.17 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.767379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  41.54 
 
 
431 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  29.57 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  27.33 
 
 
449 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  26.67 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>