49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2231 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 		 443 aa  888    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  68.76 
 
 		 439 aa  594  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  65.66 
 
 		 439 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  64.49 
 
 		 438 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  64.49 
 
 		 438 aa  568  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  62.79 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  58.47 
 
 		 441 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  41.96 
 
 		 430 aa  333  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  34.2 
 
 		 430 aa  262  8e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  37.35 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  35.12 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  35.35 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  36.53 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.73 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  35.38 
 
 		 437 aa  239  8e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  37.7 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  34.15 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  36.21 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  34.96 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  35.41 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  35.85 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  36.73 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  32.89 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  34.04 
 
 		 429 aa  220  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  36.14 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  37.09 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  35.27 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  34.68 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  32.09 
 
 		 458 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  33.33 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  35.75 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  32.96 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  36.82 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  34.22 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  33.71 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  31.31 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  30.65 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.69 
 
 		 455 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  30.93 
 
 		 456 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  29.3 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  27.49 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  28.77 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  29.66 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  29.66 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  24.79 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>