44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3729 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  100 
 
 		 440 aa  852    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  54.38 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  42.79 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  42.42 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  32.05 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  29.6 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  32.14 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  31.24 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  28.94 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  30.54 
 
 		 454 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  27.4 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  29.6 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  29.72 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  31.04 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  32.09 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  27.94 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  27.57 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  27.42 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  27.94 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  27.69 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  27.06 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  27.25 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  26.57 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  25.83 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  26.06 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  29.29 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  25.34 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  25.51 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  23.41 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  28.2 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  23.31 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  24.89 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  23.86 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  23.31 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  22.81 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  25.98 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  25.45 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  35.35 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  35.71 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  25.95 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  26.05 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>