64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6900 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  96.02 
 
 		 452 aa  888    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  100 
 
 		 452 aa  924    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  58.61 
 
 		 458 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  57.08 
 
 		 445 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  57.21 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  58.5 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  54.65 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  56.42 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  56.82 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  55.78 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  51.7 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  51.25 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  51.33 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  56.98 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  55.86 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  54.38 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  52.38 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  33.26 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  33.41 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  33.41 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.58 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  32.18 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  32.71 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  30.56 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  30.18 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  32.48 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  33.04 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  31.05 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 449 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  31.99 
 
 		 449 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  31.66 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  31.92 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  31.47 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.02 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  31.59 
 
 		 455 aa  156  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  29.51 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  31 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  30.41 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  31.03 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  28 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 		 418 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  27.02 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.74 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  35.57 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  29.45 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  32.72 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  30.14 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  31.08 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  30.61 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  30.61 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  29.45 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4180  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  45.16 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1597  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  45.16 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  28.77 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 370 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1349  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  33.65 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.376549  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1540  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  30.65 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  33.1 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>