44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3388 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 467 aa  940    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  43.27 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  42.63 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  41.94 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  32.17 
 
 		 454 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  31.82 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  29.34 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  31.78 
 
 		 451 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  29.72 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  26.96 
 
 		 446 aa  156  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  31.91 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  29.87 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  30.39 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  28.67 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  27.49 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  28.2 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  26.07 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  26.96 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  30.21 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  27.19 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  29 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  26.68 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  24.19 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  27.11 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  25.77 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  26.56 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  26.71 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  26.63 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  25.22 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  27.89 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  26.14 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  23.18 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  25.52 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  24.81 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  23.32 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  25.19 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  21.78 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  22.05 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  25.52 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  27.42 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  22.69 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>