63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3191 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  100 
 
 		 428 aa  853    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  61.59 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  61.12 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  60.66 
 
 		 437 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  62.76 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  62.5 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  58.62 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  54.69 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  53.09 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  53.09 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  34.85 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  34.19 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  35.38 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  36.26 
 
 		 443 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  34.19 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  33.41 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  33.18 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  34.75 
 
 		 424 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  32.31 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  32.31 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  32.08 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  29.4 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  30.94 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  30.94 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  30.58 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  32.81 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  31.05 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.64 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  30.82 
 
 		 452 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  31.07 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  32.14 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  32.14 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  30.48 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  32.17 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  31.36 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  29.4 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  31.79 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  28.98 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  30.18 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  27.33 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  25.55 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  27.6 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  29.55 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0011  homoserine dehydrogenase  28.68 
 
 		 466 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  29.71 
 
 		 439 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  25.76 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  33.61 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  27.97 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0012  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.728091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  26.98 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  25.81 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  28.5 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3442  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  26.45 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4155  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  28.24 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  28.99 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>