56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0572 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  100 
 
 		 429 aa  864    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  62.85 
 
 		 437 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  63.36 
 
 		 437 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  61.45 
 
 		 437 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  62.76 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  56.38 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  54.63 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  55.5 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  55.5 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  51.74 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  35.84 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  33.49 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  34.1 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  34.11 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  34.1 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  35.26 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  32.34 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  35.35 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  35.35 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  31.31 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  32.03 
 
 		 438 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  30.41 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  32.35 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  30.02 
 
 		 446 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  31.66 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  30.16 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  32.89 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  31.06 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  29.6 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  31.42 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  29.02 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  31.57 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  31.46 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  31.37 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  30.91 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  28.24 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  31.15 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  32.24 
 
 		 435 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  30.16 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  27.81 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  25.52 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  29.65 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  33.91 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  36.21 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  30.34 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  31.43 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  29.71 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  27.27 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  31.58 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  26.64 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  25.56 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5333  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.767379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>