47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1155 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 396 aa  802    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  58.71 
 
 		 377 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  30.07 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  30.55 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  31.14 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  33.01 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  31.14 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  33.87 
 
 		 437 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.4 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  34.16 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  33.23 
 
 		 428 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  31.39 
 
 		 424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  28.39 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  28.06 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  29.45 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  31.21 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  25.69 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  27 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  26.87 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  30.04 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  23.72 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  25.65 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  26.37 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  25.49 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  26.91 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  27.83 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  27.36 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  25.06 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  26.6 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  29.75 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  24.94 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  24.76 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  25.78 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  28.65 
 
 		 455 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  23.84 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  28.33 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  22.63 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  21.88 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  23.29 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  28.37 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  32.5 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2400  Homoserine dehydrogenase  29 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  35.64 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  31.3 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  30.36 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>