49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1550 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  79.5 
 
 		 453 aa  718    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  72.75 
 
 		 458 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  917    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  68.39 
 
 		 454 aa  630  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  67.94 
 
 		 452 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  66.89 
 
 		 445 aa  620  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  62.87 
 
 		 451 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  60.14 
 
 		 455 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  58.52 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  60.81 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  55.41 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  60.71 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  53.38 
 
 		 446 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  56.24 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  52.93 
 
 		 446 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  54.65 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  54.73 
 
 		 453 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  48.99 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  33.11 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  33.7 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  30.68 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  30.68 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  29.51 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  29.77 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  28.06 
 
 		 439 aa  193  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  29.44 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.7 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  33.84 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  32.68 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.52 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  30.3 
 
 		 453 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  31.49 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  30.09 
 
 		 437 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  26.74 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  29.76 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  28.03 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  29.89 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  27.13 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  29.86 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  26.91 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  29.4 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  27.4 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  22.63 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  25.3 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  33.07 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 366 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>