50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4118 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  75.23 
 
 
438 aa  675    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  80.05 
 
 
439 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  100 
 
 
439 aa  890    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  75.11 
 
 
438 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  74.77 
 
 
438 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  63.99 
 
 
441 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  65.66 
 
 
443 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  38.84 
 
 
430 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 
430 aa  252  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  36.2 
 
 
453 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  34.42 
 
 
437 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.43 
 
 
437 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  35.33 
 
 
437 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  35.07 
 
 
449 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  36.07 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  32.33 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  34.49 
 
 
449 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  34.49 
 
 
449 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  32.32 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  30.49 
 
 
452 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  34.18 
 
 
455 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
453 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  32.34 
 
 
429 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  33.26 
 
 
451 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  33.64 
 
 
434 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  34.23 
 
 
441 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  34.44 
 
 
435 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  32.18 
 
 
452 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  30.43 
 
 
454 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  33.41 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  31.74 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  30.27 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 
450 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  30.93 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  28.06 
 
 
446 aa  193  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  30.43 
 
 
445 aa  189  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  27.52 
 
 
458 aa  183  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  30.09 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  31.46 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  33.23 
 
 
424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.05 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
396 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  29.36 
 
 
456 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  25.85 
 
 
455 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  26.16 
 
 
467 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  27.52 
 
 
440 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
474 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
459 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
459 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>