58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1901 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  63.22 
 
 		 1155 aa  1247    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  63.22 
 
 		 1130 aa  1247    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  70.56 
 
 		 1133 aa  1214    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1146 aa  2222    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  57.81 
 
 		 989 aa  858    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  59.46 
 
 		 953 aa  751    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  62.98 
 
 		 1124 aa  1249    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  71 
 
 		 1139 aa  1219    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  52.78 
 
 		 1093 aa  889    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  53.43 
 
 		 957 aa  800    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  69.69 
 
 		 1133 aa  1188    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  56.13 
 
 		 938 aa  758    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  36.59 
 
 		 973 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  35.34 
 
 		 949 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  38.69 
 
 		 939 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  38.63 
 
 		 903 aa  364  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  50.35 
 
 		 1201 aa  356  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  50.11 
 
 		 1200 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  36.33 
 
 		 902 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  50.11 
 
 		 1198 aa  325  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  46.74 
 
 		 774 aa  303  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  52.62 
 
 		 1207 aa  295  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  38.16 
 
 		 891 aa  290  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  38.12 
 
 		 946 aa  286  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  35.35 
 
 		 941 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  38.7 
 
 		 1128 aa  258  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  40.14 
 
 		 1242 aa  234  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  29.79 
 
 		 1045 aa  157  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  29.44 
 
 		 600 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  33.6 
 
 		 587 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.16 
 
 		 824 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  23.65 
 
 		 778 aa  127  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.94 
 
 		 833 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  23.06 
 
 		 823 aa  92.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  23.52 
 
 		 921 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  29.46 
 
 		 1312 aa  89.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  32.1 
 
 		 573 aa  67  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  31.69 
 
 		 573 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  29.01 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  24.55 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  22.84 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  28.96 
 
 		 954 aa  61.6  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  28.96 
 
 		 954 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  25 
 
 		 573 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  29.58 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  23.51 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  29.58 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  23.51 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  40 
 
 		 679 aa  52.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1019 aa  52  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  22.37 
 
 		 856 aa  51.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  37.31 
 
 		 920 aa  47.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  25 
 
 		 939 aa  47  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  38.46 
 
 		 639 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  27.53 
 
 		 893 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  25.08 
 
 		 934 aa  45.8  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  32 
 
 		 1064 aa  45.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  29.29 
 
 		 899 aa  44.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>