200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4448 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  85.5 
 
 		 201 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  84 
 
 		 201 aa  347  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  61.93 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  59.9 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  60.1 
 
 		 200 aa  234  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  55.05 
 
 		 199 aa  234  9e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  55.05 
 
 		 199 aa  234  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  56.06 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  59.5 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  56.85 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  59 
 
 		 201 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 		 202 aa  200  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 		 202 aa  200  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  51.5 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  56.98 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  47.45 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  49.24 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  46.7 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  47.72 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  45.36 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  30.92 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  29.51 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.83 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  29.45 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.38 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  25.56 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4155  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.85 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0471031  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 		 284 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  29.2 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.27 
 
 		 259 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  24.86 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.07 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  29.32 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 337 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  29.32 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.76 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.66 
 
 		 251 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.68 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  27.22 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.82 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 		 288 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  25.29 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 284 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  29.17 
 
 		 355 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  21.51 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.21 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>