218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3649 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 344 aa  707    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  68.26 
 
 		 233 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  53.12 
 
 		 232 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  49.79 
 
 		 234 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  49.16 
 
 		 235 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  53.36 
 
 		 232 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  50 
 
 		 235 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  49.32 
 
 		 236 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  49.13 
 
 		 237 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  49.35 
 
 		 242 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  51.16 
 
 		 238 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  51.74 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  50.22 
 
 		 238 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  50.7 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  49.78 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  47.21 
 
 		 235 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  44.31 
 
 		 252 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  42.34 
 
 		 252 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  42.68 
 
 		 252 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  42.92 
 
 		 230 aa  175  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  43.2 
 
 		 259 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  41.83 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  42.68 
 
 		 252 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  41.83 
 
 		 252 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  41.98 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  38.62 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  43.23 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  40.74 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  40.74 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  47.64 
 
 		 239 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  47.64 
 
 		 239 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  37.7 
 
 		 246 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  45.86 
 
 		 251 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  41.87 
 
 		 245 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  41.99 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  47.87 
 
 		 244 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  46.15 
 
 		 238 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  38.75 
 
 		 244 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  35.98 
 
 		 250 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  45.55 
 
 		 239 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  38.2 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  40.74 
 
 		 242 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  35.05 
 
 		 225 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  33.48 
 
 		 221 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  34.04 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  36.67 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  36.11 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  31.3 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  32.79 
 
 		 231 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  31.19 
 
 		 229 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 		 230 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  32.6 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.25 
 
 		 229 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  28.5 
 
 		 223 aa  96.7  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.74 
 
 		 239 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  35.22 
 
 		 229 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  29.81 
 
 		 238 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  30.99 
 
 		 192 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  28.69 
 
 		 234 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  27.92 
 
 		 224 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  31.9 
 
 		 207 aa  89.4  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  31.9 
 
 		 207 aa  89.4  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  29.39 
 
 		 238 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  30.59 
 
 		 192 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 230 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 230 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  31.05 
 
 		 229 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  32.18 
 
 		 229 aa  85.9  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  31.05 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  31.47 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  28.92 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  31.68 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  32.14 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  31.43 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  28.43 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  29.38 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  29.41 
 
 		 226 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  31.63 
 
 		 229 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  31.64 
 
 		 231 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  29.76 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  30.37 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  29.95 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  30.97 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  30.37 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  31.07 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  30.66 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  31.82 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  26.69 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  29.13 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  30.82 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  31.13 
 
 		 221 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  30.14 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  30.82 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  32.52 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  29.19 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  29.94 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  29.19 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>