262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 
504 aa  969    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  44.74 
 
 
506 aa  342  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  46.86 
 
 
508 aa  316  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  45.45 
 
 
492 aa  313  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  46.21 
 
 
536 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  42.89 
 
 
505 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  40.6 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3965  amidohydrolase 3  44.73 
 
 
509 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  38.27 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 
513 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.41 
 
 
568 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.51 
 
 
522 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.03 
 
 
527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.57 
 
 
532 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.6 
 
 
556 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.75 
 
 
530 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.48 
 
 
543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.09 
 
 
553 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  32.33 
 
 
501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.69 
 
 
539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.17 
 
 
556 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.16 
 
 
556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.49 
 
 
546 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  31.06 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.06 
 
 
560 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.54 
 
 
583 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  32.35 
 
 
565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.89 
 
 
562 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.44 
 
 
537 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.36 
 
 
522 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.1 
 
 
522 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  23.11 
 
 
435 aa  106  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.67 
 
 
520 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  29.84 
 
 
477 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.24 
 
 
505 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.95 
 
 
522 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.17 
 
 
550 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.44 
 
 
522 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.54 
 
 
565 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.44 
 
 
522 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  32.15 
 
 
499 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  24.75 
 
 
553 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.65 
 
 
547 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.61 
 
 
557 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.3 
 
 
619 aa  103  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.84 
 
 
522 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.73 
 
 
539 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25 
 
 
522 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.15 
 
 
542 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.84 
 
 
522 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  31.64 
 
 
475 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 
544 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  24.4 
 
 
436 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.86 
 
 
542 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25 
 
 
522 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  24.81 
 
 
527 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27 
 
 
548 aa  100  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.78 
 
 
522 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.78 
 
 
522 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  39.42 
 
 
556 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  21.71 
 
 
526 aa  96.7  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.95 
 
 
574 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  22.89 
 
 
533 aa  95.9  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25.16 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  25.81 
 
 
569 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  40.38 
 
 
485 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.18 
 
 
552 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  36.64 
 
 
513 aa  93.6  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.1 
 
 
520 aa  93.6  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.09 
 
 
560 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.86 
 
 
548 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  43.96 
 
 
563 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.68 
 
 
552 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  25.06 
 
 
434 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  25.06 
 
 
434 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  36.45 
 
 
512 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  24.74 
 
 
541 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.07 
 
 
539 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.6 
 
 
540 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  27.49 
 
 
540 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.18 
 
 
538 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  25.68 
 
 
564 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  29.4 
 
 
498 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 
543 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  36.62 
 
 
547 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  37.02 
 
 
532 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  36.2 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.6 
 
 
553 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  25.71 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  30.43 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 
589 aa  84.7  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  30.63 
 
 
547 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.64 
 
 
542 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  35.75 
 
 
521 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.15 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.38 
 
 
544 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  26.46 
 
 
525 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  35.9 
 
 
536 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.36 
 
 
579 aa  83.6  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  25.75 
 
 
601 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>