More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03470  protease II  100 
 
 
709 aa  1387    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  44.46 
 
 
703 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  36.54 
 
 
698 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  37.37 
 
 
698 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  35.73 
 
 
688 aa  361  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  36.51 
 
 
706 aa  354  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  36.51 
 
 
706 aa  354  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  36.36 
 
 
706 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  35.73 
 
 
726 aa  340  5e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  33.76 
 
 
696 aa  333  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  34.09 
 
 
690 aa  333  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  34.91 
 
 
706 aa  330  7e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  35.19 
 
 
719 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  34.83 
 
 
726 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  33.24 
 
 
712 aa  320  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  33.23 
 
 
678 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  34.74 
 
 
748 aa  313  7.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  31.28 
 
 
709 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  34.41 
 
 
695 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  32.4 
 
 
744 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  31.73 
 
 
739 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  29.49 
 
 
688 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  31.73 
 
 
678 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  28.59 
 
 
686 aa  290  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  33.2 
 
 
782 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  31.29 
 
 
682 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  32.67 
 
 
678 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  31.45 
 
 
710 aa  282  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  33.62 
 
 
700 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  32.24 
 
 
698 aa  278  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.92 
 
 
671 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.99 
 
 
711 aa  276  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  26.9 
 
 
686 aa  274  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  29.14 
 
 
697 aa  273  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  30.86 
 
 
690 aa  273  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  31.43 
 
 
686 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  31.85 
 
 
686 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  31.75 
 
 
680 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.06 
 
 
713 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  32.19 
 
 
739 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  29.03 
 
 
711 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  31.68 
 
 
685 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  31.57 
 
 
680 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  32.46 
 
 
682 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  30.44 
 
 
683 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  27.66 
 
 
705 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  31.73 
 
 
680 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  31.93 
 
 
717 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  32.39 
 
 
683 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  27.12 
 
 
721 aa  264  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  33.77 
 
 
715 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  28.59 
 
 
696 aa  263  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  30.68 
 
 
686 aa  263  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  31.91 
 
 
683 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  31.3 
 
 
701 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  32.97 
 
 
695 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  31.44 
 
 
680 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  29.05 
 
 
683 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  29.05 
 
 
683 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  29.05 
 
 
683 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  28.55 
 
 
696 aa  261  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  29.7 
 
 
683 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  32.68 
 
 
685 aa  258  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  27.51 
 
 
719 aa  257  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  32.66 
 
 
711 aa  256  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  27.2 
 
 
697 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  33.14 
 
 
714 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  29.64 
 
 
683 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  27.69 
 
 
696 aa  252  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  31.5 
 
 
699 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  30 
 
 
697 aa  251  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  30.39 
 
 
684 aa  250  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  34.11 
 
 
715 aa  251  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  32.8 
 
 
714 aa  250  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  31 
 
 
701 aa  249  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  29.12 
 
 
701 aa  247  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  29.34 
 
 
709 aa  247  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  32.84 
 
 
710 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  29.9 
 
 
708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  30.25 
 
 
703 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  28.27 
 
 
683 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  28.27 
 
 
683 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  28.27 
 
 
683 aa  243  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  28.27 
 
 
683 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  28.27 
 
 
683 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  28.83 
 
 
677 aa  243  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  28.85 
 
 
691 aa  243  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  29.62 
 
 
686 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  29.62 
 
 
686 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  27.63 
 
 
722 aa  241  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  29.31 
 
 
686 aa  241  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  30.78 
 
 
686 aa  240  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  30.23 
 
 
717 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  29.24 
 
 
686 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  32.01 
 
 
696 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  29.24 
 
 
686 aa  239  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  29.24 
 
 
686 aa  239  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  29.35 
 
 
729 aa  237  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  28.63 
 
 
702 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  28.85 
 
 
686 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>