More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3286 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3286  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4331  GntR family transcriptional regulator  85.37 
 
 		 214 aa  353  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4717  transcriptional regulator, GntR family  85.37 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4496  GntR family transcriptional regulator  85.37 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4343  GntR family transcriptional regulator  85.37 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4847  GntR family transcriptional regulator  85.37 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4728  transcriptional regulator, GntR family  85.37 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4733  GntR family transcriptional regulator  84.88 
 
 		 214 aa  352  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0525  transcriptional regulator, GntR family  85.37 
 
 		 214 aa  352  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4432  regulatory protein GntR HTH  84.88 
 
 		 214 aa  350  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4712  transcriptional regulator, GntR family  83.33 
 
 		 189 aa  305  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  41.5 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.54 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  39.1 
 
 		 239 aa  91.3  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 232 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.65 
 
 		 240 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  33.58 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  36.63 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.64 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  33.83 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  32.58 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  28.5 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  34.15 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  30.09 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  29.81 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.6 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  29.03 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  37.06 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  30.63 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  27.69 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  27.18 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  27.94 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.39 
 
 		 257 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.39 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  33.12 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  29 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.39 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.65 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.38 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.38 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.38 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  26.92 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  32.93 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.15 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.39 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  39.02 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  47.06 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.37 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.52 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.71 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  27.22 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.09 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.3 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.51 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  28.65 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  40 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  37.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  30.46 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  41.56 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  29.66 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  36.13 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  30.19 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  28.5 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>