More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1283 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  100 
 
 
304 aa  624  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  42.86 
 
 
305 aa  245  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  39.61 
 
 
306 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  40.13 
 
 
306 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  28.15 
 
 
304 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.68 
 
 
300 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  26.01 
 
 
301 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 
295 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  25.42 
 
 
319 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.75 
 
 
329 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  29.66 
 
 
292 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  26.51 
 
 
319 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  26.51 
 
 
319 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 
301 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  26.51 
 
 
319 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  29.59 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  25.17 
 
 
332 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.87 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.22 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  26.48 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  26.91 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  30.31 
 
 
299 aa  95.5  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 
299 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25.09 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.81 
 
 
300 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.81 
 
 
300 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.52 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  24.05 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  26.03 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.87 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.1 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 
305 aa  90.1  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  24.07 
 
 
342 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  25.44 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.86 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  27.74 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  23.02 
 
 
322 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.2 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  25.48 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.87 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.46 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  23.93 
 
 
307 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  23.22 
 
 
309 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  24.11 
 
 
343 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  25.93 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  24.53 
 
 
335 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  27.21 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  24.11 
 
 
343 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.92 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  27.24 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  23.63 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  25.17 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.78 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  23.97 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  23.6 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  26.64 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  23.97 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  27.85 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  24.38 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.13 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.34 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.33 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  24.18 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  27.08 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4984  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.57 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5363  prophage lambdaba03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.57 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  26.92 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  22.84 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.59 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  23.51 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.67 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  26.46 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  23.18 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  25.79 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  22.34 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.43 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  23.63 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  26.3 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>