More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7271 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7271  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  607  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7486  LysR family transcriptional regulator  79.34 
 
 		 309 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1836  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  69.31 
 
 		 313 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7162  LysR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7274  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 327 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.32 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  30.72 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  29.79 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2319  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0282  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  30.21 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6414  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.773226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5246  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.3 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>