More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3156 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 368 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  89.42 
 
 		 323 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 317 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  28.57 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.67 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 319 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 319 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  22.61 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.24 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.62 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  25.58 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3134  helix-turn-helix domain-containing protein  36.61 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.22 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  24.26 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.33 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 777 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.5 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.03 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.68 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  29.93 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  23.05 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  23.05 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.05 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.05 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  33.83 
 
 		 791 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 1121 aa  63.5  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  31.61 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>