More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2139 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2139  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666769  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0735  EmrB/QacA family drug resistance transporter  69.85 
 
 		 471 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2310  major facilitator superfamily permease  71.02 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.24 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0603  major facilitator family transporter  71.02 
 
 		 468 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1720  major facilitator family transporter  71.02 
 
 		 468 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.02 
 
 		 468 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1658  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.02 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2227  major facilitator family transporter  71.02 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  48.98 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3715  major facilitator transporter  49.66 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0943  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3032  major facilitator family transporter  42.02 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  42.7 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  42.47 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3116  major facilitator family transporter  42.47 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0225466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3220  major facilitator family transporter  42.02 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0324  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 462 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2369  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.52805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47260  putative MFS transporter  56.59 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 		 558 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.42 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 558 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.67 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.84 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 534 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.91 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  26.24 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 514 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.67 
 
 		 476 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  27.18 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.65 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.18 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.46 
 
 		 526 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 541 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.92 
 
 		 635 aa  147  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 477 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.39 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  26.94 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.5 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  26.54 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  26.3 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.83 
 
 		 489 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 474 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.99 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.53 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.16 
 
 		 579 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 		 529 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 		 520 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.32 
 
 		 467 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 		 529 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 523 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 		 517 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.91 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.1 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.23 
 
 		 503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.81 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.23 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 578 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.87 
 
 		 458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 		 509 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.91 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 		 564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 540 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
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NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  29.29 
 
 		 523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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