More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2227 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2310  major facilitator superfamily permease  99.15 
 
 		 468 aa  881    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1658  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.35 
 
 		 465 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2227  major facilitator family transporter  100 
 
 		 468 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.15 
 
 		 471 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0735  EmrB/QacA family drug resistance transporter  88.22 
 
 		 471 aa  703    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.36 
 
 		 468 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0603  major facilitator family transporter  99.36 
 
 		 468 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1720  major facilitator family transporter  99.36 
 
 		 468 aa  882    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2139  major facilitator transporter  71.02 
 
 		 461 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666769  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3715  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47260  putative MFS transporter  51.79 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0943  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3032  major facilitator family transporter  39.16 
 
 		 402 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3116  major facilitator family transporter  39.16 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0225466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  39.16 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0324  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  39.16 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3220  major facilitator family transporter  38.94 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2369  major facilitator superfamily MFS_1  49 
 
 		 452 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.52805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 514 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 		 515 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 558 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 534 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  27.19 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  27.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.99 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.27 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.83 
 
 		 476 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 483 aa  156  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 545 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.09 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 523 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.8 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 495 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 558 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 		 478 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 488 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 635 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.38 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  26.7 
 
 		 465 aa  141  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 482 aa  140  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 492 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 492 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 474 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 474 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.73 
 
 		 470 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  27.69 
 
 		 554 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  27.59 
 
 		 492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  27.59 
 
 		 492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.43 
 
 		 503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  26.62 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.16 
 
 		 490 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 502 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 529 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 492 aa  136  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 477 aa  136  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 466 aa  136  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.34 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 508 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1665  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1410  hypothetical protein  27.98 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1590  hypothetical protein  27.98 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.34 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>