More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0355 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.78 
 
 		 474 aa  871    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  90.72 
 
 		 474 aa  822    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  100 
 
 		 474 aa  932    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  92.41 
 
 		 474 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  95.15 
 
 		 474 aa  867    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.41 
 
 		 474 aa  831    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  95.15 
 
 		 474 aa  867    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.07 
 
 		 476 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  68.87 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  69.09 
 
 		 479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  55.72 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  51.1 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  51.42 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.53 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  52.4 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.11 
 
 		 487 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  48.07 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  49.22 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.83 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.61 
 
 		 490 aa  365  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.67 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 491 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.82 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 490 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 481 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  47.47 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  42.16 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.63 
 
 		 467 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 493 aa  336  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 498 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 493 aa  336  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.3 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.87 
 
 		 465 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  43.04 
 
 		 462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 484 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  39.43 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 467 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.12 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.44 
 
 		 474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 471 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 462 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 471 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 479 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.17 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4121  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0932  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.96 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.997162  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  35.68 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  38.73 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 476 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1410  hypothetical protein  34.86 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  32.61 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  32.61 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  32.61 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  32.61 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  32.61 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1590  hypothetical protein  34.2 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 475 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237506  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.48 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564553  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2018  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.858513  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1135  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.24 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0750633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.24 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>