More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0914 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  68.57 
 
 		 474 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  100 
 
 		 473 aa  932    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  70.68 
 
 		 474 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  69.58 
 
 		 470 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.91 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  60 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  57.89 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 529 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  55.09 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.86 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.09 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  53.22 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.66 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  48.41 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  49.13 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  50.55 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  50.33 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.48 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  50.33 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 		 467 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 467 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.8 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  42.95 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.51 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  44.49 
 
 		 465 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 480 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.69 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 474 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.23 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 471 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 462 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 462 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 471 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 471 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 486 aa  338  8e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 465 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 487 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.72 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.58 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.58 
 
 		 486 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.58 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.58 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 462 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.45 
 
 		 479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 477 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 479 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  39.87 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.9 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 474 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 474 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.15 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.88 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000216435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  41.01 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.06 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  36.56 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  36.56 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  36.56 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  36.56 
 
 		 475 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  38.15 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  38.15 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  38.15 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  38.15 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  38.15 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  38.15 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  36.12 
 
 		 475 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 481 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.93 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 		 475 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1410  hypothetical protein  36.12 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1590  hypothetical protein  36.34 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  38.17 
 
 		 474 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  36.81 
 
 		 484 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 482 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>