More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0932 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0932  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  100 
 
 		 468 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.997162  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.44 
 
 		 490 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 490 aa  333  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  40 
 
 		 495 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.6 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 480 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 493 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  39.12 
 
 		 495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.13 
 
 		 474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  40.13 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 489 aa  303  6.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.44 
 
 		 471 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.96 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 487 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.76 
 
 		 483 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 467 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  39.46 
 
 		 498 aa  293  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 		 474 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 474 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.89 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 462 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.46 
 
 		 469 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 464 aa  282  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  36.76 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 465 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 		 465 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 		 465 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 		 486 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.25 
 
 		 479 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.28 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 467 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 529 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 486 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 482 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 		 495 aa  262  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 481 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 481 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 493 aa  256  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  33.8 
 
 		 475 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  33.8 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  33.8 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  33.8 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  34.84 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  33.8 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  34.84 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  34.84 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  33.8 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 475 aa  250  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  34.84 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  35.1 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  33.57 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  33.86 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 494 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 478 aa  246  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000216435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 		 478 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>