More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4654 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.62 
 
 		 474 aa  852    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  91.14 
 
 		 474 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  92.41 
 
 		 474 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  92.62 
 
 		 474 aa  854    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 474 aa  931    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  92.62 
 
 		 474 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  98.52 
 
 		 474 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.64 
 
 		 476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  67.31 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  69.09 
 
 		 479 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  55.79 
 
 		 477 aa  491  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.4 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  51.1 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.98 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 489 aa  405  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  45.47 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.27 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.49 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 		 481 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.49 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 490 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 495 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 481 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 504 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 		 491 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 499 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  48.03 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  41.94 
 
 		 495 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 467 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 491 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 498 aa  342  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 		 493 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.04 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 465 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.27 
 
 		 465 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.4 
 
 		 469 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  42.13 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 484 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 529 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  38.27 
 
 		 473 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 488 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  40 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 462 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.7 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.11 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 479 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 462 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 479 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  39 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.6 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.6 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.6 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.39 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 481 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 495 aa  299  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 		 476 aa  296  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4121  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0932  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.13 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.997162  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  32.97 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 476 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  32.97 
 
 		 475 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  32.97 
 
 		 475 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  32.97 
 
 		 475 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  34.13 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  32.4 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 		 482 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  32.4 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  32.4 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  32.4 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.4 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  32.4 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  32.4 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  32.97 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  38.97 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>