More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4121 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4121  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
471 aa  906    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 
493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  42.58 
 
 
490 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 
476 aa  352  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 
482 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  47.86 
 
 
481 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.26 
 
 
480 aa  346  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 
489 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
478 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  41.45 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  42.37 
 
 
486 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
481 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 
487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2018  major facilitator transporter  49.51 
 
 
455 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.858513  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  41.3 
 
 
465 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 
481 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3603  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 
464 aa  300  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 
481 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  35.87 
 
 
462 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 
476 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.09 
 
 
490 aa  293  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  39.14 
 
 
474 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  42.42 
 
 
467 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  40.56 
 
 
474 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  40.56 
 
 
474 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  40.56 
 
 
474 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.13 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.5 
 
 
483 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  37.05 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
479 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 
477 aa  282  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  37.07 
 
 
504 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 
474 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  39.91 
 
 
474 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 
472 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  36.15 
 
 
495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 
493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  38.05 
 
 
495 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.35 
 
 
479 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 
491 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  39.41 
 
 
493 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
467 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 
493 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  39.1 
 
 
499 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  39.3 
 
 
491 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 
471 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.36 
 
 
467 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  35.95 
 
 
467 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  37.97 
 
 
471 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.41 
 
 
469 aa  254  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  34.16 
 
 
464 aa  253  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
467 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.8 
 
 
465 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
529 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 
474 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 
484 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.36 
 
 
495 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  37.8 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  37.8 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  37.8 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  37.8 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  37.8 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
465 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
480 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  35.46 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.17 
 
 
475 aa  243  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  35.24 
 
 
471 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  36.78 
 
 
475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  37.97 
 
 
479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  36.78 
 
 
475 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 
475 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  36.78 
 
 
475 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.78 
 
 
475 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.78 
 
 
475 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.54 
 
 
475 aa  240  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  34.58 
 
 
486 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.83 
 
 
474 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.9 
 
 
470 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  34.58 
 
 
465 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 
465 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 
465 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 
486 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 
471 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 
465 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 
465 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  34.58 
 
 
471 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  34.36 
 
 
471 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  36.3 
 
 
475 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  34.58 
 
 
471 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  33.26 
 
 
498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  34.36 
 
 
462 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1410  hypothetical protein  33.92 
 
 
461 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  34.14 
 
 
462 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.5 
 
 
467 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  32.68 
 
 
479 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  33.69 
 
 
462 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1590  hypothetical protein  34 
 
 
461 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  35.21 
 
 
488 aa  229  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  33.55 
 
 
473 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>