More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3715 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3715  major facilitator transporter  100 
 
 		 459 aa  895    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  62.31 
 
 		 459 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47260  putative MFS transporter  50.11 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0735  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.18 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0943  major facilitator transporter  50 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2310  major facilitator superfamily permease  48.55 
 
 		 468 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2227  major facilitator family transporter  48.78 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.33 
 
 		 471 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.55 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1720  major facilitator family transporter  48.55 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0603  major facilitator family transporter  48.55 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1658  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.55 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2139  major facilitator transporter  50.87 
 
 		 461 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666769  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0324  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2369  major facilitator superfamily MFS_1  48.36 
 
 		 452 aa  236  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.52805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 514 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.82 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3116  major facilitator family transporter  59.34 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0225466 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3032  major facilitator family transporter  59.34 
 
 		 402 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  59.34 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  59.34 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3220  major facilitator family transporter  58.79 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 558 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 480 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 480 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  28.85 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.85 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.34 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  28.85 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.34 
 
 		 476 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 510 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.28 
 
 		 480 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 		 545 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.2 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.58 
 
 		 541 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 		 534 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 523 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 466 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 		 558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 529 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.83 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.83 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.43 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  26.5 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 559 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 473 aa  163  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 514 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 485 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 531 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.25 
 
 		 515 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.25 
 
 		 490 aa  159  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  28.22 
 
 		 482 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  27.32 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.97 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.6 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.64 
 
 		 520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  27.97 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.75 
 
 		 515 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 		 534 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 473 aa  156  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
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NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.9 
 
 		 506 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.19 
 
 		 537 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.63 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.79 
 
 		 570 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
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NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.18 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 504 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  27.68 
 
 		 554 aa  151  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
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