More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5816 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  100 
 
 
257 aa  517  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  98.83 
 
 
257 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  98.05 
 
 
257 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  98.44 
 
 
257 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  98.05 
 
 
257 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  98.44 
 
 
257 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  94.55 
 
 
271 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  80.93 
 
 
257 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.32 
 
 
257 aa  430  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.77 
 
 
257 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.27 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.26 
 
 
257 aa  407  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  72.76 
 
 
257 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  82.1 
 
 
257 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 
257 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  70.82 
 
 
257 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.93 
 
 
257 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.48 
 
 
257 aa  331  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  56.75 
 
 
247 aa  294  8e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.87 
 
 
250 aa  279  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  51.97 
 
 
252 aa  268  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  49.83 
 
 
279 aa  254  9e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  47.64 
 
 
256 aa  234  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  46.46 
 
 
257 aa  229  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
286 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.11 
 
 
174 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
246 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
246 aa  158  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
247 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
242 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
245 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
245 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
245 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
245 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  32.06 
 
 
265 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
254 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
247 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
246 aa  141  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
247 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
246 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
246 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  33.6 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
246 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.77 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
246 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
253 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
254 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  33.08 
 
 
264 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
245 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
248 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
245 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
245 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
248 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
245 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
244 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
252 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
249 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.1 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.86 
 
 
255 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  32.55 
 
 
247 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202973  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.56 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.08 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>