More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3337 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  82.49 
 
 
257 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.21 
 
 
257 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.77 
 
 
257 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.6 
 
 
257 aa  424  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  77.82 
 
 
257 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  78.6 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  78.6 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  78.6 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  78.6 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  78.6 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  78.6 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  78.6 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  80.93 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  84.82 
 
 
257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  83.27 
 
 
257 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  71.21 
 
 
257 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  76.26 
 
 
257 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  75.88 
 
 
257 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  74.41 
 
 
271 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  75.88 
 
 
257 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  75.49 
 
 
257 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  75.1 
 
 
257 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  75.1 
 
 
257 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.2 
 
 
257 aa  347  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.98 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  55.34 
 
 
247 aa  278  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  51.18 
 
 
252 aa  264  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.52 
 
 
250 aa  261  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  48.08 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  47.29 
 
 
256 aa  231  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  46.12 
 
 
257 aa  229  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.17 
 
 
174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
286 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
229 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
250 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
247 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
246 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
246 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
245 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
254 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  31.54 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
246 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
247 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
250 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
247 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
246 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  34.4 
 
 
247 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.53 
 
 
246 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
245 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
246 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
248 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
253 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
247 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
245 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
245 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
245 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
249 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  33.86 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
255 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
248 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.27 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
256 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.27 
 
 
254 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
257 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
245 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  29.39 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
254 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.02 
 
 
249 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
249 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>