More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3247 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.56 
 
 
250 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.51 
 
 
257 aa  184  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.49 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.75 
 
 
257 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
257 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  53.16 
 
 
247 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  53.46 
 
 
257 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  55.35 
 
 
271 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  48.62 
 
 
279 aa  161  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  59.12 
 
 
257 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  57.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 
257 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  50.91 
 
 
257 aa  158  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  55.97 
 
 
257 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  55.97 
 
 
257 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  55.97 
 
 
257 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  55.97 
 
 
257 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  55.35 
 
 
257 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  55.35 
 
 
257 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  46.11 
 
 
256 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
252 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  44.51 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  56.94 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 
257 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.51 
 
 
286 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.7 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
250 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 
250 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
247 aa  92  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
246 aa  89  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  36.96 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
296 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
247 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.99 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.14 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  35.15 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.35 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
271 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  30.77 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  31.61 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  30.26 
 
 
288 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  34.88 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.264822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>