More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65964 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  100 
 
 
257 aa  517  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  75.6 
 
 
256 aa  385  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  53.01 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  52 
 
 
252 aa  259  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
250 aa  238  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
257 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 
257 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
257 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 
257 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  46.85 
 
 
271 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
257 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
257 aa  225  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
257 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
257 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  48.84 
 
 
279 aa  223  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  46.9 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
257 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
257 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
257 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
257 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 
257 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
286 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
250 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
247 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 
246 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
246 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
246 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.51 
 
 
229 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  34.29 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
250 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
253 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.1 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
246 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
247 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.23 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.23 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.23 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.23 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.23 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
246 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
242 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
243 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  32.17 
 
 
265 aa  122  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
262 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
245 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
245 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
245 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  31.82 
 
 
247 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
250 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
247 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
256 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.33 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
253 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
254 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
253 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>