More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1873 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  100 
 
 
257 aa  517  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  100 
 
 
257 aa  517  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  98.83 
 
 
257 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  99.61 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  98.83 
 
 
257 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  98.44 
 
 
257 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  94.55 
 
 
271 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.32 
 
 
257 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  80.93 
 
 
257 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.16 
 
 
257 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.27 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.88 
 
 
257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  71.98 
 
 
257 aa  391  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 
257 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  80.54 
 
 
257 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  71.21 
 
 
257 aa  374  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 
257 aa  357  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.09 
 
 
257 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  55.95 
 
 
247 aa  290  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 
250 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  51.57 
 
 
252 aa  268  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  49.83 
 
 
279 aa  254  7e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  46.46 
 
 
256 aa  230  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  46.06 
 
 
257 aa  228  9e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
286 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
250 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.11 
 
 
174 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
246 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
246 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
242 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
246 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
247 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
245 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  32.44 
 
 
265 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.89 
 
 
246 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
247 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
247 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
246 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
247 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
250 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  34.4 
 
 
247 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
260 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
250 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
253 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
244 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  32.7 
 
 
264 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
245 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
245 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  32.94 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.5 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
245 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.2 
 
 
246 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  34.25 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
257 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
246 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>