More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2236 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.38 
 
 		 257 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.82 
 
 		 257 aa  457  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  84.82 
 
 		 257 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  82.49 
 
 		 257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  96.89 
 
 		 257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.21 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.1 
 
 		 257 aa  441  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  85.99 
 
 		 257 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  82.1 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  80.93 
 
 		 257 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  79.38 
 
 		 271 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  80.93 
 
 		 257 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  74.32 
 
 		 257 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.04 
 
 		 257 aa  345  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.81 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  56.52 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  48.43 
 
 		 279 aa  251  9.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  48.45 
 
 		 256 aa  235  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  46.12 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.67 
 
 		 174 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 286 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 		 229 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  30.92 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.52 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 255 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>