More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4060 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  99.52 
 
 		 210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  90.95 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  88.1 
 
 		 210 aa  358  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  87.62 
 
 		 210 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  56.87 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  59.33 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.13 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  46.6 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  45.37 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  45.85 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  45.85 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.65 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  42.11 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.33 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  35.92 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.55 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.92 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.92 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.92 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.96 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  29.27 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.93 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  27.69 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.85 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.15 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27.69 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27.69 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27.69 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.3 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  30.3 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.18 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.18 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.18 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.18 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  27.18 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  30.43 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.74 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.33 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.74 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.33 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.71 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  33.33 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  33.33 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.71 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  26.57 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.71 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  33.33 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  33.33 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.43 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  27.98 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.96 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  32.22 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.46 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.46 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.46 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.46 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.46 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  29.24 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.06 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.28 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.45 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.89 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  28.27 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.9 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  29.65 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  28.27 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  29.65 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  29.65 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  29.65 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  34.01 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  31.45 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>