103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6817 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  100 
 
 
208 aa  423  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  40.79 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  38.93 
 
 
169 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  40.54 
 
 
242 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.54 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.82 
 
 
207 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  40.82 
 
 
207 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  40.14 
 
 
245 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  38.26 
 
 
183 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  38.82 
 
 
180 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  40.14 
 
 
242 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  34.51 
 
 
177 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  40.14 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  42.54 
 
 
162 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  38.78 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  38.78 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  38.78 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  38.78 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  38.78 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  38.78 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  38.78 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  38.03 
 
 
175 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  36.73 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  37.41 
 
 
183 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.5 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  43.66 
 
 
186 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  37.33 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  39.84 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.01 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.39 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  35.95 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  40 
 
 
176 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  30.46 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  35.29 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  33.77 
 
 
184 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  36.36 
 
 
758 aa  84.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  34.53 
 
 
176 aa  85.1  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  34.53 
 
 
176 aa  85.1  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  33.33 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  34.44 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.59 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  37.41 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  32.86 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  35 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  32.41 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  38.4 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  38.4 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  34.56 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.38 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.87 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  30.22 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  28.06 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  34.31 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  31.74 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.54 
 
 
363 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  32.7 
 
 
393 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.45 
 
 
386 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  30.56 
 
 
376 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.85 
 
 
219 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  29.14 
 
 
286 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  28.26 
 
 
286 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  36.28 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.01 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  32.5 
 
 
294 aa  55.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  26.16 
 
 
260 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  32.38 
 
 
481 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  26.19 
 
 
467 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.4 
 
 
472 aa  52.4  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.85 
 
 
528 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  28.99 
 
 
479 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  29.52 
 
 
487 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05796  phospholipase D active site domain protein  28.48 
 
 
404 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.81 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  24.32 
 
 
359 aa  48.5  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 
366 aa  48.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 
575 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  28.38 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  24.27 
 
 
545 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  29.79 
 
 
355 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  25.16 
 
 
543 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  28.95 
 
 
389 aa  45.8  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  22.33 
 
 
545 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  22.33 
 
 
545 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  27.36 
 
 
282 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  33.59 
 
 
476 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  30 
 
 
394 aa  43.1  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  33.33 
 
 
470 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  23.62 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1112  hypothetical protein  27.43 
 
 
479 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.09 
 
 
476 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  25.44 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.3 
 
 
551 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.09 
 
 
476 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  27.08 
 
 
458 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  32.63 
 
 
210 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  26.57 
 
 
299 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  26.57 
 
 
299 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  33.68 
 
 
201 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>