109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3688 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
331 aa  604  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.5 
 
 
341 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.54 
 
 
348 aa  215  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  48.84 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  47.78 
 
 
357 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  50.99 
 
 
314 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  46.49 
 
 
356 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  43.55 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  43.55 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  43.23 
 
 
359 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  39.81 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  42.26 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.16 
 
 
321 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 
328 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  39.66 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.51 
 
 
331 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  45.05 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  36.45 
 
 
351 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  35.14 
 
 
322 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  32.89 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  33.86 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  29.63 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.7 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.95 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.4 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.5 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.67 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.67 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.6 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.33 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  23.99 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  32.29 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  32.77 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  32.35 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  32.35 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  32.35 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  32.35 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  32.48 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  32.48 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  32.48 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  32.34 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  32.48 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.73 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  20.2 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 
298 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.38 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  28.17 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  22.26 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  31.31 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  23.9 
 
 
297 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
298 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  23.75 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.8 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  25.43 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
520 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.03 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  24.14 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  28.81 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  25.57 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.87 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  22.04 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  30.87 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.19 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.6 
 
 
308 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.23 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  27.67 
 
 
295 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  27.81 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  25 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  21.27 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  21.82 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24340  predicted permease, DMT superfamily  31.67 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.167703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  23.74 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  24.16 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  30.04 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.05 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  26.04 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  23.23 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  25.66 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  23.23 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  25.66 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  28.25 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  38.37 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  25.66 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  18.27 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  27.33 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  22.73 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.38 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  26.71 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.18 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  33.58 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  32.03 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>