217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2089 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  60.68 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  58.26 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  50.88 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  49.58 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  59.55 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  44.07 
 
 		 118 aa  94  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  42.37 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  41.18 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  38.14 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  38.66 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  39.23 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  40.71 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  38.84 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  37.82 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  36.13 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  38.6 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  42.39 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  36.44 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.25 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  36.21 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  38.79 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  37.35 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  34.71 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  37.19 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  31.58 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  34.78 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  44.44 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  33.88 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  41.05 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  38.54 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  38.55 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  39.51 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  35.04 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  32.53 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  40.96 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  32.97 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  45 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  31.82 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  36.14 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  32.32 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  32.26 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  42.17 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  40.23 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  35.8 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  29.06 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  31.68 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  33.66 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  33.66 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  38.37 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  32.18 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  43.08 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  33.62 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  34.78 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  35.29 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  28.07 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  36.71 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  34 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  35.56 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  30.21 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  30.1 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  32.65 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  38.3 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  36.99 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  31.71 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  30.34 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  52.17 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  27.19 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  31.91 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  34.44 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  29.36 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  29.51 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  28.57 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  32.98 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  27.5 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  32.98 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  32.98 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  26.55 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  40 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  32.56 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  28.97 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  35.62 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  26.45 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  28.57 
 
 		 284 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  30.39 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  35.44 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  37.35 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  29.52 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  34.23 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  28.8 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  42.37 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  27.73 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  46.27 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>