230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5460 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  245  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  55.46 
 
 		 121 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  49.14 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  40.16 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  37.39 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  40.17 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  41.13 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  37.61 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  41.13 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  34.17 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  42.31 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  33.93 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.04 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  33.06 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  33.93 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  30.83 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  36.97 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  37.17 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  45.36 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  44.19 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  34.82 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  35.9 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  31.53 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  31.25 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  34.82 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  36.56 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  38 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  35.24 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  31.86 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  31.36 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  34.51 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  28.83 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  31.93 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.04 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  30.43 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  29.46 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  35.29 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  38.89 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  30.36 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  29.17 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  31.3 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  34.55 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  32.76 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  29.2 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  37.82 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  30.3 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  29.06 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  33.66 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  36.47 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  33.65 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  32.73 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  39.44 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  39.44 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  31.37 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  39.44 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  34.34 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  31.58 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  31.93 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.46 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  27.88 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  39.24 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  35.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  33.04 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  28.57 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  27.35 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  31.37 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  32.5 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  30.77 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  29.75 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  34.48 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  30.16 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  27.59 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  31.07 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  30.25 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  35.71 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  29.31 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  35.37 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>