261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6196 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  100 
 
 		 140 aa  278  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  62.14 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  61.43 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  60.29 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  61.43 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  60 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  59.29 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  59.29 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  62.18 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  62.71 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  62.71 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  57.86 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  56.03 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  55.8 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  56.92 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  55 
 
 		 143 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 143 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  55 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  52.48 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  52.48 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  52.48 
 
 		 246 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  59.5 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  52.48 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  52.48 
 
 		 243 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  52.48 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  52.48 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  55.71 
 
 		 140 aa  146  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  52.86 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  54.61 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  53.9 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  57.85 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  53.15 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  52.14 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  49.64 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  49.64 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  56.67 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  52.59 
 
 		 391 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  50.36 
 
 		 279 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  54.17 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  52.5 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  55 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  50.36 
 
 		 284 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  55.74 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  49.64 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  51.67 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  51.67 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  51.67 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  47.97 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  44.83 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  50.83 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  50.83 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  50.83 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  50.83 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  51.64 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  43.88 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  48.33 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  46.32 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  47.83 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  45.83 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  45.83 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  45.83 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  45.83 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  48.31 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  45.83 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  44.35 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  45 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  42.34 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  44.17 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  45.38 
 
 		 261 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  42.03 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  43.94 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  44.63 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  45.22 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  44.35 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  43.44 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  39.13 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  41.48 
 
 		 138 aa  95.9  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  38.41 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  37.5 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  32.86 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  42.11 
 
 		 168 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  42.11 
 
 		 168 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  42.11 
 
 		 168 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  35.51 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  43.24 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  37.14 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  36.13 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  30.25 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  39.5 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  34.07 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  39.47 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  36.27 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>