231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3549 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  93.75 
 
 		 112 aa  217  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  53.15 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  49.14 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  49.41 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  40.54 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  38.05 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  39.64 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  43.18 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  41.82 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.94 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  44.25 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  41.44 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  41.44 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  41.44 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  32.41 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  37.84 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  42.17 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  38.3 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  34.23 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  33.94 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  40.74 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  38.82 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  38.39 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  37.84 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  40.74 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  39.24 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.29 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  39.24 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  39.24 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  39.24 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  40.74 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  33.94 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  39.51 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  37.84 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  42.7 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  38.55 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  36.47 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  32.73 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  34.55 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  38.75 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  37.08 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  39.02 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  34.55 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  40.74 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  41.98 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  37.5 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  39.02 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  34.82 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  39.29 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  40.96 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  39.51 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  36.59 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  36.25 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  37.21 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  45.21 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  36.71 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  35.9 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  41.86 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  42.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  34.57 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  34.57 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  34.86 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  39.13 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  39.24 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  31.36 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  33.72 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  32.53 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  37.21 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  37.68 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  37.04 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  36 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  37.65 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  32.2 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  34.52 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  37.14 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  39.24 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  34.23 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  32.74 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  29.73 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  34.45 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>