232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3057 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  69.91 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  66.67 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  64.55 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  54.55 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  49.19 
 
 		 233 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  42.11 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  42.24 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  40.71 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  41.23 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  38.6 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  43.12 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  39.64 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  43.36 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.18 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  36.94 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  37.04 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  44.94 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  42.7 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  37.29 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  35.23 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  36.75 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  33.94 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  43.42 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.63 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  50.68 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  37.84 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  39.78 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  35.71 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  41.11 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  45 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  36.36 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  36.47 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  34.04 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  47.95 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.63 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.63 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  35.19 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  39.02 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  30.33 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  33.03 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  37.18 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  32.18 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  35.92 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  37.8 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  37.93 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  31.73 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  35 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  35.9 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  32.74 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  31.58 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  36.92 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  38.89 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  34.74 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  35.09 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  29.81 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  38.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  41.11 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  35.48 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  31.31 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  29.81 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  38.14 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  30.3 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  45.61 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  36.17 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  39.82 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  38.27 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  35.37 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  34.04 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  31.3 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  34.52 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  34.52 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  35.56 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  34.38 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  34.52 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  34.25 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  30 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  34.52 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  34.52 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  34.52 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  34.52 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  32.69 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  39.19 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>