259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0545 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  100 
 
 		 118 aa  244  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  54.39 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  47.79 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  56.67 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  47.79 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  49.14 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  55 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  47.41 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  42.24 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  56.63 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  44.35 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  45.61 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  56.63 
 
 		 116 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  49.12 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  42.37 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  41.53 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  41.03 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  50.59 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  40.71 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  48.78 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  48.78 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  47.56 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  47.56 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  36.52 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  41.11 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  48.15 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  48.05 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  48.15 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  38.18 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  38.18 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  44.44 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  37.93 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  37.93 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  35.65 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  33.03 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  39.67 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  38.79 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  38.46 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  39.82 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  37.29 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  41.77 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  33.62 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  33.33 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  38.6 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  37.14 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  38.1 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  32.2 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  44.3 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  40 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  38.26 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  40.59 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  31.86 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  32.11 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  37.14 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  33.91 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  40.91 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  33.91 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  42.05 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  37.65 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  36.78 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  36.78 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  36.78 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  42.68 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  37.19 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  42.17 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  35.96 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  37.61 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 		 389 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  40.7 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  35.65 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  36.21 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  41.38 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  35.65 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  35.65 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  41.94 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  41.94 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  35.63 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  41.38 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  41.94 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  41.94 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  41.94 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  41.94 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>