269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1555 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  100 
 
 		 118 aa  240  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  52.46 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  53.28 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  49.57 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  59.55 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  52.21 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  43.48 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  43.8 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  46.9 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  45.76 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  43.86 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  39.23 
 
 		 233 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  42.11 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  40 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  45.69 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  41.44 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  38.79 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  40.35 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.07 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  33.63 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  36.7 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  36.04 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  42.05 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  42.17 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  38.26 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  35.14 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  40.54 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  40.54 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  40.54 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  44.58 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  44.58 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  46.99 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  37.62 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  35.24 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  38.05 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  36.04 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  40.66 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  43.37 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  43.37 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  43.37 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  38.74 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  42.17 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  33.91 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  40.52 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  46.84 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  32.43 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  36.04 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  34.23 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  41.98 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  35.71 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  42.17 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  30.7 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  34 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  36.73 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  37.8 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  44.05 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  40.74 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  42.68 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  39.02 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  41.46 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  36.71 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  31.3 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  35.59 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  35.96 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  37.8 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.24 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  45.95 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  31.9 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  31.86 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  46.34 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  35.96 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  32.22 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  40.96 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  36.26 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  34.44 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  34.44 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  34.44 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  35.14 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  34.23 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  31.36 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  34.44 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  31.36 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  37.01 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  31.36 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  32.35 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  31.36 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  35.45 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  33.71 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  36.84 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>