242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2715 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  57.14 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  51.69 
 
 		 122 aa  131  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  51.69 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  50.42 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  47.9 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  45.76 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  43.64 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  41.88 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  41.38 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  40.17 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  39.82 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  41.59 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  38.6 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  33.93 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  35.59 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  39.29 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  34.38 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  39.82 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  33.93 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  35.71 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  34.82 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  37.39 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  36.94 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  39.84 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  32.77 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  33.04 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  38.74 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  37.5 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  43.84 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  43.02 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  35.48 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  33.93 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  35.71 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  34.51 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  41.98 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  31.86 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  41.98 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  41.98 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  31.53 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  33.93 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  33.93 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  33.93 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  33.93 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  33.93 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  41.98 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  33.93 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  33.93 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  36.36 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  35.9 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.96 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  35.9 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  33.04 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  32.73 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  33.61 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  30.95 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  30.95 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  30.95 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.8 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  43.21 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  32.43 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  34.23 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.33 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  33.33 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  31.78 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  28.57 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  37.72 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  36.9 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  32.43 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  31.71 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  31.25 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  33.9 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  43.16 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  29.84 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  29.84 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  29.84 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  34 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  34.17 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  45.45 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  27.68 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  45.74 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  32.2 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  33.9 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>