53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6074 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  32.26 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  34.4 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  35.9 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  32.56 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  38.46 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  33.33 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  32.52 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  30.47 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  31.97 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  33.85 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  34.53 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  29.06 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  28.57 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  31.36 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  30.56 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  29.2 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  29.92 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  26.67 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  29.75 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  26.67 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  28.21 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  27.78 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  27.5 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  26.92 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  24.58 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  24.17 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  24.17 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  27.5 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  22.5 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  23.73 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  30.23 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  30.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  26.5 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  28.57 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  25.64 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  36.49 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  22.4 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  30.1 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  30.1 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  27.45 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  28.69 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  29.75 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  28.69 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  27.35 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  26.67 
 
 		 118 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  31.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  28.81 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  26.05 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  26.21 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  26.89 
 
 		 117 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>