258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03730 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  61.54 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  62.14 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  60 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  57.75 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  57.64 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  57.64 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  56.94 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  59.57 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  60.43 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  59.71 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  57.55 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  55.94 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  56.83 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  52.82 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  53.85 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  53.85 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  61.6 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  61.6 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  53.9 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  47.89 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  55.73 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  53.68 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  55.32 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  50.36 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  50.36 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  50.36 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  50.36 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  50.36 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  50.36 
 
 		 246 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  50.36 
 
 		 243 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  51.45 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  49.65 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  52.17 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  52.85 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  50.74 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  52.85 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  54.17 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  47.22 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  52.85 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  51.47 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  52.5 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  50 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  50.35 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  52.03 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  52.03 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  52.03 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  52.03 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  49.64 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  51.67 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  50 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  51.59 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  51.43 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  45 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  50.83 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  47.5 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  46.77 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  44.44 
 
 		 284 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  45.32 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  45.32 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  48.74 
 
 		 261 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  48.39 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  47.2 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  47.15 
 
 		 138 aa  106  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  46.34 
 
 		 279 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  48.76 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  47.01 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  46.28 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  45.04 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  45.9 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  44.88 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  43.44 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  39.86 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  41.27 
 
 		 251 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  43.55 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  43.55 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  43.55 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  43.22 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  41.48 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  39.42 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.23 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  43.97 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  38.26 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  36.96 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  40 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  37.24 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  37.39 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  44.68 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  39.6 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  36.56 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  36.56 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>