263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5220 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  246  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  78.26 
 
 
122 aa  194  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  63.25 
 
 
123 aa  157  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  56.56 
 
 
122 aa  154  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  51.69 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  46.55 
 
 
116 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  47.54 
 
 
122 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  48.36 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  42.98 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  47.06 
 
 
120 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  42.61 
 
 
120 aa  97.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  39.13 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  40.16 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  35.96 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  37.1 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  48.31 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  36.43 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  41.41 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  34.78 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  38.05 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  38.6 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  39.66 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  34.21 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  36.28 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  29.91 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  33.61 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  37.72 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  38.26 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  33.91 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  35.96 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  35.09 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  33.61 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  30.25 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  32.17 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  31.09 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  35.29 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  67  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  35.16 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  34.21 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  38.1 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  31.09 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  37.39 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  34 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  33.62 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  34.21 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  32.54 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  35 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.34 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  30.43 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  34.43 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  33.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  31.58 
 
 
117 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  35.9 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  33.05 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  39.53 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  33.06 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  36.21 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  31.9 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  39.13 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  31.86 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  36 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  37.82 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  38.55 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  35.09 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  32.17 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  40.19 
 
 
135 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  35.05 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  35.16 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  30.7 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  38.2 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  34.88 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  33 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  34.69 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  42.55 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  43.37 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  38.55 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  42.55 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  35.71 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  43.62 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  37.3 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0227  YCII-related protein  36.21 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  33.04 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  33.33 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  31.9 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  31.9 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  31.9 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  33.04 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  31 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>